При использовании постоянных соединений необходимо помнить также ещё две вещи.
Первое - при использовании блокировки таблицы при постоянном соединении, если скрипт по каким-то причинам не может освободить блокировку, последующие скрипты, использующие то же самое соединение, будут блокированы бесконечно долго и могут потребовать рестарта httpd-сервера или сервера БД.
Второе - что, при использовании транзакций, блок транзакции также будет перенесён в следующий скрипт, использующий это соединение, если выполнение скрипта заканчивается до окончания выполнения блока транзакции. В этом случае вы можете использовать register_shutdown_function() для регистрации простой функции зачистки для разблокирования ваших таблиц или отката ваших транзакций. Ещё лучше избежать этих проблем полностью, не используя постоянные соединения в скриптах, где используются блокировка таблиц или транзакции (вы всё ещё можете использовать их в других местах).