Использование PHP как двоичного CGI это опция установки, когда, по некоторым соображениям, нет желания интегрировать PHP как модуль в программу-сервер (такую как Apache) или когда PHP будет использоваться с различными видами CGI-оболочек для создания для скриптов безопасной среды chroot и setuid. Такая инсталяция обычно заключается в установке исполняемого файла PHP в директорию cgi-bin web-сервера. CERT advisory CA-96.11 рекомендует не помещать никакие интерпретаторы в директорию cgi-bin. Даже если исполняемый файл PHP используется как самостоятельный интерпретатор, PHP разработан таким образом, чтобы предотвратить атаки при таком варианте установки:

• Доступ к системным файлам: http://my.host/cgi-bin/php?/etc/passwd

  Информация запроса в url после знака вопроса (?) передаётся интерпретатору как аргументы командной строки CGI-интерфейсом. Обычно интерпретаторы открывают и выполняют файл, специфицированный как первый аргумент командной строки.

  При вызове как исполняемый CGI, PHP не выполняет аргументы командной строки.

• Доступ к любому web-документу на сервере: http://my.host/cgi-bin/php/secret/doc.html

  Информация пути/path в url после имени PHP-экзешника, /secret/doc.html, используется по соглашению для специфицирования имени файла, открываемого и исполняемого CGI -программой. Обычно некоторые директивы конфигурации web-сервера (Apache: Action) используются для перенаправления запросов документа, например, http://my.host/secret/script.php, интерпретатору PHP. При такой установке web-сервер сначала проверяет права доступа к директории /secret, а затем создаёт перенаправленный запрос http://my.host/cgi-bin/php/secret/script.php.
  К сожалению, если запрос в оригинале задан в этой форме, проверка доступа к файлу /secret/script.php web-сервером не выполняется, и он делает её только для файла /cgi-bin/php. Этим способом любой пользователь может получить доступ к /cgi-bin/php и к любому защищённому документу на web-сервере.

  В PHP опция конфигурации времени компиляции --enable-force-cgi-redirect и директивы времени выполнения doc_root и user_dir могут использоваться для предотвращения таких нападений, если дерево документов сервера содержит директории с ограниченным доступом. См. далее рассмотрение различных комби